fas Shahroud University of Medical Sciences مجله دانش و تندرستي در علوم پایه پزشکی 1735-577X 2345-3753 2025-09-13 15 24 10.22100/jkh.v20i2.3427 4475 نگیسا زارعی 0 https://orcid.org/0009-0004-3562-7513 رضا حبیبی پور 1 https://orcid.org/0000-0002-1632-2624 - کارشناس ارشد میکروبیولوژی، گروه میکروبیولوژی، دانشکده علوم پایه، دانشگاه آزاد اسلامی واحد همدان، همدان، ایران. - دانشیار، گروه میکروبیولوژی، دانشکده علوم پایه، دانشگاه آزاد اسلامی واحد همدان، همدان، ایران. مقدمه: خواص منحصر به فرد باکتری‌های اندوفیت به خوبی مشخص نیست. باکتری‌های اندوفیت برخی گیاهان مانند Rhabdosciadium aucheri، ممکن است با خواص ضدمیکروبی قارچ‌های بیماری‌زا از بین ببرند. هدف از این مطالعه توالی‌یابی و رسم درخت فیلوژنیک باکتری‌های اندوفیت گیاه R.aucheri به روش sanger sequencing و تعیین اثر ضد قارچی آنها می‌باشد. مواد و روش‌ها: نمونه‌های گیاهی در این مطالعه ﺗﻮﺻﻴﻔﻲ- تحلیلی با روش تصادفی و آسان و در دسترس جمع‌آوری شدند. روش کشت بر روی پلیت برای شناسایی اولیه باکتری‌های اندوفیت استفاده گردید. روش PCR برای تشخیص مولکولی باکتری‌های اندوفیت و تعیین توالی بهینه‌سازی شد. اثر مهاری این باکتری‌های اندوفیت بر آسپرژیلوس نایجر و کاندیدا آلبیکنز به روش کشت متقاطع سنجیده شد. نتایج: از مجموع 100 ایزوله‌ی باکتریایی جدا شده از R.aucheri، 9 ایزوله (9%) باسیلوس پومیلوس، 15 ایزوله (15%) باسیلوس سوبتیلیس، 12 ایزوله (12%) سراشیا فیکاریا، 14 ایزوله (14%) باسیلوس آمیلولیکوفاسینس، 8 ایزوله (8%) پانتوئه‌آ آگلومرانس و 7 ایزوله (7 درصد) سوداروباکتر اکسیدانس بودند. نتایج تعیین توالی نشان دادند که تفاوت گونه‌های مختلف باسیلوس مربوط به جایگاه‌های T و G بودند. همچنین باسیلوس‌های جداسازی شده بیشترین تأثیر را برروی قارچ آسپرژیلوس نایجر نشان دادند. نتیجه‌گیری: با استناد به نتایج ما، ریشه گیاه R.aucheri محلی مناسب برای جداسازی باسیلوس‌های دارای پتانسیل بالای ضد میکروبی است. همچنین مشخص شد که گونه باسیلوس سوبتیلیس در مقایسه با باکتری‌های دیگر قدرت بیشتری برای مهار قارچ‌های بیماری‌زا دارد. Introduction: The unique properties of endophytic bacteria are not well known. Endophytic bacteria of some plants, such as Rhabdosciadium aucheri, may inhibit pathogenic fungi with antimicrobial effects. The purpose of this study is to sequence and draw the phylogenetic tree of R.aucheri endophytic bacteria by the Sanger sequence method and determine their antifungal effect. Methods: In this descriptive-analytical study, plant samples were collected using a random, convenient, and accessible method. The initial identification of endophytic bacteria was performed using the plate culture technique. Molecular detection and sequencing of the bacteria were carried out using optimized PCR methods. Results: Out of 100 bacterial isolates obtained from R. aucheri, the distribution was as follows: Bacillus pumilus made up 9% (9 isolates), Bacillus subtilis 15% (15 isolates), Serratia ficaria 12% (12 isolates), Bacillus amyloliquefaciens 14% (14 isolates), Pantoea agglomerans 8% (8 isolates), and Pseudarthrobacter oxydans 7% (7 isolates). Sequencing analysis indicated that variations among the Bacillus species were primarily associated with differences at the cytosine (C) and guanine (G) nucleotide positions. Among the isolates, those belonging to the Bacillus genus displayed the most significant inhibitory effect against Aspergillus niger. Conclusion: Our findings indicate that the roots of the R. aucheri plant provide a favorable environment for isolating Bacillus species with high antimicrobial activity. Among the isolated bacteria, Bacillus subtilis exhibited the most potent antifungal effect against pathogenic fungi. https://knh.shmu.ac.ir/index.php/site/article/view/3427 لاکتوباسیلوس پلانتاروم تعیین توالی باکتری‌های اندوفیت آسپرژیلوس Aspergillus Bacillus, Sequencing, Endophytic bacteria,